ДНК тесты и генеалогия

[avramenko]

MOCKBA: Тема переживает взрывное развитие - половина новых страниц всего за один год из почти десятилетней истории темы. Тут и технические советы и вопросы, и рассказы об удачах или удивительных открытиях, и обсуждение распродаж ... Поскольку ориентироваться в такой многостраничной ветке стало трудно, я собрал самые важные ссылки в первое сообщение и прикрепил его.

Общая информация о хромосомах, наследовании, и переменчивости ДНК (2009)
Про три типа тестов: аутосомный, Y-хромосомы и ДНК митохондрий (мтДНК) (2010); Подробнее про те же три типа анализов, со ссылками (2012)

Полезные ссылки: какая часть генома наследуется при разных степенях фактического родства (в среднем, а не у ашкеназов)
http://www.isogg.org/wiki/Autosomal_DNA_statistics ; http://dna-explained.com/2013/09/29/why ... my-cousin/
и насколько больше совпадений бывает между ашкеназами

Как меняется с дальностью родства длина совпадающих сегментов (2017) (+2024)
Как работает "раскраска хромосом" по этническому происхождению ДНК (2017), ( + 2020), почему народы России оказываются за пределами списков этнических ДНК в результатах анализов (2017) и как усовершенствования техники анализа все-таки позволяют "поставить страны Восточной Европы" на карту этнического состава хромосом (2018)

+ Исследования исторической генетики евреев (тема эта развивается быстро с развитием технологий и с ростом охвата населения генетической генеалогией, так что самые старые источники могут оказаться менее точными)
"Впервые сопоставив полные геномы евреев из общин разных стран, ученые установили единство их происхождения, точные сроки, когда эти группы разошлись, и географию их древних миграций." (2014)
Из какого генетического теста сделаны собственно ашкеназы (2018) (+2019) (+2020 )
Насколько схожи другие еврейские народы с ашкеназами и друг с другом (2020)
и более узко-технически: что происходит в ДНК, если праотцы-мигранты берут праматерей из местных (2017)

[MCB]

Как-то нелогично, если в совместный проект по сравнению генетических даных приглашают сразу в многих разделах, но я тоже не уверен, где лучше.

[mashax]

Я уже довольно подробно рассказывал вам про "завалы" (pile-ups). Ваша собственная ДНК далеко не всегда входит в состав самых известных завалов, но может входить в состав менее известных. Если вы не на Анцестри, то можетe чуть-чуть проимитировать результаты их алгоритма "Timber" (про который я рассказывал в моем старом ответе на ваш вопрос), скачав таблицу всех совпадающих сегментов и построив гистограмму количества совпадений по позициям на хромосомаx. Это будет на удивление неоднородное распределение. Некоторые участки вашей ДНК оказутся в гигантских пиках такой диаграммы, с гораздо бОльшим числом совпадений, чем в среднем. Можетe считать эти участки вашими "персональнами завалами", и относиться к совпадениям в этих участках с соответствующим сомнением.

У меня такой «персональный завал» на 10-й хромосоме, вдали от теломер и центромеры. В списках известных завалов этого места нет. Завал виден как в импортированном MyHeritage, так и в первоисточнике, FTDNA. Длина - 16сМ. Совпаденцы географически «правильные», из моего уезда, но неблизкие, общий родственник не позже середины 19 века. Друг с другом незнакомы. Чем можно объяснить такой завал?

[хая шулькина]

У меня такой «персональный завал» на 10-й хромосоме, вдали от теломер и центромеры. В списках известных завалов этого места нет. Завал виден как в импортированном MyHeritage, так и в первоисточнике, FTDNA. Длина - 16сМ. Совпаденцы географически «правильные», из моего уезда, но неблизкие, общий родственник не позже середины 19 века. Друг с другом незнакомы.

И вот тут начинается самая занудная работа...Каждому написать,попросить пригласить как гостя в древо.У вас уже есть общие места рождений,зайти в Jewish gen,поискать по фамилиям дальних предков их родителей в рождениях,браках.
В нашей истории много пробелов-Холокост,эмиграция до революции,уничтоженные архивы в синагогах...

[dimaioffe]

проект днк Gedmatch по Витебской губернии одобрен и запущен!

Имеет смысл присоединяться, если витебский только дед? А отец (позже будут еще данные моей мамы)?

[ЛияК]

проект днк Gedmatch по Витебской губернии одобрен и запущен!

Имеет смысл присоединяться, если витебский только дед? А отец (позже будут еще данные моей мамы)?

присоединяйтесь, ненужное не покажет, а если перекрестное, то уж с совпаденцами будете сами разбираться, откуда связь )

[MCB]

Евреи-ашкеназы - просто итальянцы по ДНК, с небольшой ближневосточной примесью??? Нет, просто замечательный новый метод анализа геномов на происхождение предков перестает работать на глубинах более 12 поколений назад.

Новая статья генетиков из компании OmnicsEdge из Майами https://www.nature.com/articles/s41467-025-59936-3 усовершенствовала алгоритмы "раскраски хромосом" по наиболее вероятному предковому происхождению каждого из хромосомных сегментов. В первую очередь их интересовала, конечно, генетика смешанного населения Латинской Америки, но одним из их самых больших источников данных служил Британский Биобанк, а там было немало евреев и меньшинств из Африки и Азии. По латиноамериканцам у них всё разложилось по полочками очень даже замечательно. Индейских корней было в целом больше всего в Перу, итальянских - в Аргентине, британских и африканских - на некоторых карибских островах... Хорошо определились исторические меньшинства - ашкеназы Аргентины, японцы Бразилии и Перу, потомки индийских подневольных рабочих в Гайане.

А вот с евреями-ашкеназами вышло неожиданно: 2/3 Италии, 1/6 Леванта, большая часть остатка - регион Турции / Ирака / Ирана, а восточноевропейских предков меньше 2%. Отчего такая фигня?
Тут надо объяснить, как работает алгоритм OmnicsEdge. Они сравнивают реальную последовательность ДНК с образцами из других современных народов, и рассчитывают, сколько раз надо перетасовать фрагменты из какого-либо народа, чтобы получилось в точности как есть в исследуемой последовательности. Сам так делал для похожих целей, но у них получился более быстрый алгоритм. Проблемы, однако, в нём есть, в первую очередь двух сортов:
1. Современные народы нередко сильно отличаются от древних предков (например, Левант сильно изменился генетически после арабизации), а представители современных народов в Британском биобанке особенно сильно отличаются (например, из Ирака уезжали в первую очередь евреи и христиане; доходит до смешного - большинство уроженцев стран Аравийского полуострова в биобанке оказались британцами по крови, а не арабами!).
2. Чем глубже в прошлом произошло смешение народов, тем на меньшие фрагменты раздробились, перемешиваясь, их ДНК, и, чтобы воссоздать такую степень раздробления и смешивания, алгоритму OmnicsEdge придется перетасовать сегменты ДНК современных народов столько много раз, что алгоритм отбросит такую идею как малоправдоподобную. Авторы сами пишут об этом. В их тестировании, их алгоритм хорошо работал на глубине 6 поколений, и более-менее правдоподобно до 12 поколений (это примерно 300 лет). Но более древние смешения народов их алгоритм вряд ли раскроет сколь-либо правильно.

В истории ашкеназского народа, смешение со славянами было около 20 поколений назад, а с народами Западного Средиземноморья и того глубже, более 50 поколений назад.

А почему всё-таки современные итальянцы оказались ближе всего к ашкеназам при таком анализе? А просто потому, что оба народа сложены одинаково древним смешением схожих народов - западных и восточных средиземноморских. Но у евреев восточно-средиземноморская компонента существенно выше, естественно, и поэтому даже сравнительно неточный из-за древности смешения анализ всё-таки определяет часть современной еврейской ДНК как родственную современным народа Леванта. А вот разбитая на мельчайшие крохи славянская ДНК в таком анализе остается почти невидимой. В реальности у ашкеназов, в зависимости от региона их происхождения, может набраться до 20-25% славянской ДНК, но мелко измельченной...

Откуда в анализе OmnicsEdge в ашкеназской ДНК вылезает до 10% сегментов, более похожих на иммигрантов из Ирака или Турции или Ирана, сказать труднее, но я подозреваю, что это из-за потомков балканских, багдадских и персидских евреев в этих иммигрантских популяциях.

[Nicolay]

Биотехнологическая компания Regeneron приобретет 23andMe из банкротства за 256 миллионов долларов, с планом поддержания бесперебойной работы компании по тестированию ДНК и соблюдения ее обещаний по защите конфиденциальности.
В своем объявлении о приобретении Regeneron заверила 15 миллионов клиентов 23andMe, что их данные, включая генетическую и медицинскую информацию, генеалогию и другую конфиденциальную личную информацию, будут в безопасности и в надежных руках. Regeneron намерена использовать большой массив генетических данных для продолжения своей собственной работы с использованием генетики для разработки медицинских достижений — то, что 23andMe пыталась сделать, но не смогла.
https://arstechnica.com/science/2025/05 ... -for-256m/

[MCB]

23andMe из банкротства

дело кончилось тем, что компанию выкупила её же бывшая хозяйка

[MCB]

Вышла довольно безумная статья, пытающаяся доказать, что у ашкеназских евреев почти что не было европейских корней - только ближневосточные, с помощью нереалистичных математических моделей.

Автор - израильский математик на пенсии Иосси Ливни - решил отбросить все исследования ДНК ашкеназов последних двух десятилетий, и вернуться к набору ашкеназских мтДНК, опубликованному в 2004 году и проанализировать спектр частот разных гаплогрупп мтДНК. Проанализировать в предположении, что примерно 6 веков назад ашкеназы практически вымерли и их оставалось всего около 150-300 человек.

В таком случае мтДНК почти всех этих праматерей должна до сих встречаться в потомстве достаточо часто, с частотами от долей процента до нескольких процентов. Если же какая-то мтДНК встречается у ашкеназов существенно реже, то надо предполагать, что она пришла не от той теоретической горстки потомков. И такие необычно редкие мтДНК в этом наборе есть, их около 15%.

Ливни ничтоже сумняшеся делает вывод, что эти 15% пришли от гоек, смешавшихся с ашкеназами в последние 5-6 столетий, а остальные 85% - чисто еврейские. Хотя и современная ДНК, и древняя ДНК из того же Эрфурта давно подтвердила, что уже тогда евреи Европы были смешанным народом. Собственно, в тексте препринта Ливни тоже отмечает, что частотный анализ сам по себе неспособен определить, были ли "основные праматери" ближневосточного или европейского происхождения, но тут же отметает сам вопрос, напоминая нам, что во времена Арабского Халифата политические границы Леванта и Европы были не такими, как сейчас, а, значит, европеек той эпохи вполне допустимо называть ближневосточной популяцией.

На самом деле в ашкеназских геномах не так мало редких вариантов, которые не вписываются в упрощение "150-300 предков". И многие из них как раз пришли от евреев. В принципе хорошо известно, что эта теоретическая узкая группа предков-основателей - это не предки "вообще всех ашкеназов", а предки самых быстрорастущих еврейских популяций, в первую очередь евреев Великого Княжества Литовского, которое начала заселять горстка евреев из Малопольши в 1500е, но потомки которых небывало выросли в численности и затмили своим числом более западные ашкеназские группы (рост численности которых строго ограничивали драконовские христианские законы). Но во все прошлые века, ашкеназские популяции не существовали в полной изоляции; особенно ученых мужей раввинов приглашали издалека. Это постоянное небольшое смешение между еврейскими общинами дало современному ашкеназскому генофонду целый пласт редких генетических вариантов - слишком редких, чтобы вписываться в упрощенную модель 150-300 предков, ибо такие редкие генетические варианты действительно унаследованы не от немногочисленных главных предков литваков, а от других еврейских общин. (В данных статьи 2004 года, которые использовал Ливни, как раз черным по белому видно, что общины Западной Европы заметно отличались по генетике мтДНК от восточноевропейских)

Однако в модели Ливни никаких других общин в Европе не предполагается. Только 150 общих предков-основателей. А откуда же тогда редкие мтДНК? А это уже, получается, не от евреек, а "абсорбированные" от гоек, принимавших иудаизм в последующие столетия после "эпохи основателей". Понемногу в каждом поколении. Насколько много браков с гойками? В модели Ливни "выходит", что каждый 200-й брак в каждом поколении последних столетий был с нееврейками, прошедшими гиур, а всего таких принявших иудаизм женщин должно было быть почти 10 тысяч... Думаю, что единственный вывод, который тут напрашивается - что и у еврейского народа теперь появился свой Фоменко - составитель безумных математических моделей истории, не имеющих с реальностью ничего общего...

https://scholar.google.com/scholar?hl=e ... tion&btnG=

[napobo3]

И подсоединил Скорецкого в качестве свадебного генерала.
Нашел чем заняться на пенсии, и слава богу.

[латур]

23andMe из банкротства

дело кончилось тем, что компанию выкупила её же бывшая хозяйка

И что это значит для простого пользователя?

[MCB]

дело кончилось тем, что компанию выкупила её же бывшая хозяйка

И что это значит для простого пользователя?

что самые панические опасения о том, что данные пользователей могут достаться в плохие руки и что их надо срочно удалять, явно не оправдались